Центр компетенции по анализу единичных клеток (ЦКПАЕК), является штатной единицей Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины РНИМУ им.Н.И.Пирогова. Задачами центра являются исследования в области клеточной биологии, стволовых клеток человека, методов репрограммирования клеток человека для нужд биомедицины. Одним из центральных выполняемых проектов является мероприятие 2.2.6. «Разработка технологии репрограммирования аутологичных фибробластов кожи для лечения диабета 1-го типа». Также наша группа выполняет множество других смежных научных проектов в коллаборации с другими научными подразделениями РНИМУ им.Н.И.Пирогова и научными подразделениями других организаций (например ФЦМН ФМБА, ИБР РАН, ИБГ РАН, ИМБ РАН и т.д.), выполняя специфические работы с культурами клеток, в которых мы можем проявить свои компетенции. За последние 3 года (2019-2022г) с нашим участием было опубликовано 23 научных статьи индексируемых в системе PubMed (15 из них из Q1 SJR).

Список наших компетенций (методы, стратегии, подходы):

• Культивирование клеток человека и млекопитающих (выделение первичных культур, клеточные линии, криобанкирование и т.д.)
• Плюрипотентные стволовые клетки (культивирование, репрограммирование в ИПСК, дифференцировка ПСК в нейральные стволовые клетки, нейроны, эндотелий, бета-клетки и т.д.), 3D-культивирование в сфероидах и органоидах
• Измерение уровня экспрессии генов (qRT-PCR, RT-ddPCR, bulk RNAseq, scRNA-seq)
• Трансгенез методами лентивирусных трансдукций и транспозонных систем (Sleeping Beauty)
• Нокаут генов при помощи CRISPR/Cas9 (и в целом создание произвольных делеций в произвольных локусах генома)
• Активация и сайленсинг генов при помощи CRISPR-опосредованных активаторов и ингибиторов
• Иммуноцитохимия, флуоресцентная и конфокальная микроскопия, проточная цитометрия, клеточный сортинг